Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Nudt21Q9CQF3 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Nudt21Q9CQF3 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms