Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp27Q8CEG8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp27Q8CEG8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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