Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pcsk9Q80W65 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Pcsk9Q80W65 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Pcsk9Q80W65 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Pcsk9Q80W65 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Pcsk9Q80W65 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Pcsk9Q80W65 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms