Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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