Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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