Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms