Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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