Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
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