Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Hoxd13P70217 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms