Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ufm1P61961 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ufm1P61961 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms