Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms