Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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