Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SftpdP50404 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SftpdP50404 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms