Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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Rpl28P41105 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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