Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms