Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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