Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms