Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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