Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TtrP07309 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms