Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm21818J3KMS6 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm21818J3KMS6 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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