Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Morf4l2-214ENSMUST00000166930 1926 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Trim39Q9ESN2 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim39Q9ESN2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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