Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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