Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Pacsin3Q99JB8 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms