Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trip10Q8CJ53 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms