Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms