Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubash3bQ8BGG7 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms