Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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NischQ80TM9 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms