Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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