Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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