Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.6 ms