Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf224Q3UIW8 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms