Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccndbp1Q3TVC7 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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