Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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