Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Siah1bQ06985 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Siah1bQ06985 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms