Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Top2aQ01320 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms