Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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Sh3bp1P55194 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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Sh3bp1P55194 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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