Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms