Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VdrP48281 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VdrP48281 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms