Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cd28P31041 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms