Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.4 ms