Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.2 ms