Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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