Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ifnb1P01575 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms