Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms