Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ChmQ9QXG2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ChmQ9QXG2 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms