Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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