Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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