Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Prpf39Q8K2Z2 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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