Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hdac7Q8C2B3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac7Q8C2B3 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms