Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Trim17Q7TPM3 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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